手順としては以下のとおり、

※4.0環境で最新の状態にする
> apt-get update
> apt-get -s upgrade
(なにがアップデートされるか確認)
> apt-get upgrade
(アップデートの実施)

※apt-lineを4.1に変更する
> vi /etc/apt/sources.list
(4.0を4.1に変更)

※4.1でupdateを実施
> apt-get update
> apt-get -s dist-upgrade
(削除されるものがないか確認、削除されるものがある場合はあとで再インストールする)
> apt-get dist-upgrade

※再起動
> /sbin/shutdown -r now

以上で終わりです！

dist-upgradeは初体験だったのでちょっと緊張しました（*’ー’）